鸡的绿壳蛋性状主要由SLCO1B3基因上游EAV-HP逆转录病毒插入导致，虽然SLCO1B3显性突变纯合的群体都产绿壳蛋，但是蛋色深浅却仍然存在着较大差异，因此本研究认为绿壳蛋颜色深浅还受到其他多基因的影响。本研究利用455只东乡高产绿壳蛋鸡SLCO1B3基因显性纯合个体，进行了蛋色眼观分级和蛋壳色素定量测定。本研究选择前期在21号染色体定位到的关联单核苷酸多态性（SNP）位点，利用飞行时间质谱技术进行基因型鉴定，寻找与绿壳蛋色素含量相关联的SNP。结果表明：6个SNP与绿壳蛋色素含量显著关联，对应6个候选基因AJAP1、CAMTA1、SDHB、MRPS16、DJ-1和PRDM16。本研究结果对绿壳蛋鸡的选育具有重要的意义。