本研究旨在探讨杜洛克猪(D)、长白猪(L)、大白猪(Y)3个西方引进品种以及地方培育品种鲁莱黑猪(U)与沙乌头猪(S)的杂交利用情况。利用技术平台“基于基因组简化与测序的基因型判型(GGRS)”检测单核苷酸多态性(SNP)并判定基因型。应用全基因组性状特异的SNP分子标记来估算不同群体间的遗传距离,从生长、肉质、胴体、繁殖与健康5个性状对沙乌头猪不同杂交模式下的杂种优势进行预测。结果显示:共找到生长、肉质、胴体、繁殖与健康性状潜在相关基因的SNP分别为27 739、43 041、17 730、38 259、24 111个;在二元杂交组合中,♂大×♀沙(Y×S)为较优组合;在三元杂交组合中,♂沙×♀长大(S×LY)为较优组合;在四元杂交组合中,♂杜鲁×♀大沙(DU×YS)为较优组合。本研究通过生物信息学技术开展沙乌头猪不同杂交模式的杂交优势预测,可大大减少后续配合力实验,为沙乌头猪的保种与杂交利用提供参考。