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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2024 VOL.60  >>   Issue(8)   >>  97-104

遗传育种

沙乌头猪生长发育及繁殖性状全基因组关联研究

李何君;张彩云;李拓芜;马裴裴;吴昊旻;徐忠惠;陆雪林;

作者单位:

1.上海农林职业技术学院2.上海交通大学农业与生物学院3.上海市动物疫病预防控制中心4.上海市崇明区种畜场

作者简介:

李何君(1978-),男,湖南澧县人,博士,高级畜牧师,主要从事猪遗传育种与繁殖研究,E-mail:lihejun1015@163.com

通信作者:

马裴裴(1988-),女,河南新乡人,博士,副教授,主要从事动物统计组学与生物信息学研究,E-mail:peipei.ma@sjtu.edu.cn;

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摘要
闭合
本文旨在通过全基因组关联分析方法鉴定与沙乌头猪生长发育及繁殖性状相关的基因。本研究数据来自沙乌头猪保种场2019年采集的26头生产公猪和207头生产母猪,采集耳组织样后,利用中芯一号基因芯片进行检测,经过填充及质控后,使用主成分分析方法检验群体分层情况。同时测定这些猪的生长发育及繁殖数据,包括6月龄体重、体长、胸围、体高、胸深及总产仔数、产活仔数、死胎数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重,使用混合线性模型对这些性状分别进行全基因组关联分析。结果表明,沙乌头猪群体内无明显分层。全基因组关联分析方法鉴定到影响产活仔数的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点共计11个,与初生窝重、体重、胸围显著关联的SNP分别为7、1、1个。为查找关联基因,检测了显著位点上下游100 kb的区段,除产活仔数以外,其他性状均未找到关联基因。与产活仔数关联的基因共计19个,其中CRABP2、STON1、KCNK12、MSH2、VANGL2 5个基因前期被报道与繁殖性状有关,这些基因可作为与沙乌头猪产活仔数关联的候选基因,后续可通过试验进一步验证。本研究为沙乌头猪...
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033