苏山猪是以大白猪和苏钟猪为亲本培育而成的新品种，因疾病流行和转群等因素影响，苏山猪群体存在遗传背景不清的问题，急需重建系谱，为苏山猪持续选种选育和推广提供依据。本研究采用18个基于短散布元件（Short Interspersed Elements,SINE）的逆转录转座子插入多态（Retrotransposon Insertion Polymorphisms,RIPs）标记在苏山猪群体进行PCR鉴定，对苏山猪进行系谱重建，以亲本群体长白猪、大白猪、二花脸猪、梅山猪为参考，进行遗传参数、遗传距离、系统发育和主成分分析，以进一步探究苏山猪的遗传多样性。基于非加权组平均法（Unweighted Pair-Group Method with Arithmetic Means,UPGMA）将苏山猪群体分为10个家系，苏山猪家系的多态信息含量（Polymorphic Information Content,PIC）范围为0.1605～0.2259，遗传分化指数（Wright'sF-statistics,Fst）的范围为0.0503～0.3848，近交系数（Wright's F-statistics,Fis）的范围为-0.3894～-0.2730，而其他亲本品种猪的PIC范围为0.0580～0.2485,Fst的范围为0.410 3～0.497 9,Fis的范围为-0.098 0～0.013 1。研究表明苏山猪群体遗传多样性丰富。此研究结果为苏山猪系谱构建和推广扩繁提供了一定的理论依据。