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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2024 VOL.60  >>   Issue(8)   >>  129-134

遗传育种

大白猪产仔数性状加权一步法全基因组关联分析

蔡晓钿;钟展明;魏趁;林清;徐志婷;吴细波;李加琪;张哲;

作者单位:

1.华南农业大学动物科学学院,广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室,国家生猪种业工程技术研究中心2.广西农垦永新畜牧集团有限公司

作者简介:

蔡晓钿(1997-),女,广东潮州人,博士研究生,主要从事猪遗传育种研究,E-mail:cxt0804@163.com

通信作者:

张哲(1984-),男,河南南阳人,博士,教授,主要从事猪遗传育种研究,E-mail:zhezhang@scau.edu.cn

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摘要
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研究旨在检测影响产仔数性状的基因组区域和候选基因,以期解析猪产仔数性状的遗传结构。以来自2个养殖场的8 938头大白猪为试验群体(基因分型个体1 173头),研究利用加权一步法全基因组关联分析(Weighted Single-step Genome-wide Association Study,wssGWAS)检测与1~5胎的总产仔数(Total NumberBorn,TNB)和产活仔数(TotalNumberBorn Alive,NBA)显著关联的基因组区域,并根据显著关联区域的物理位置进行候选基因注释及Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析。大白猪产仔数性状的遗传参数估计结果表明,TNB遗传力为0.11±0.01,NBA遗传力为0.08±0.01。研究共检测到16个显著关联大白猪产仔数性状的基因组窗口(窗口解释超过1%的遗传方差),这些显著的基因组窗口(0.4 Mb)分别解释了TNB和NBA约1.0%~2.4%和1%~3%的遗传方差。根据上述显著的基因组区域,研究共注释到49个性状候选关...
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033