本研究旨在通过对丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状的全基因组关联分析（Genome Wide Association Study,GWAS），挖掘与丫杈猪生长发育、胴体和肉质性状相关的遗传标记和功能基因。以166头丫杈猪为试验材料，通过提取耳组织DNA并采用中芯一号芯片进行单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）检测，采用Plink(V1.90)对获得的基因型数据进行质控，利用GEMMA软件的混合线性模型对质控结果进行生长发育、胴体和肉质性状相关的GWAS分析。结果表明，有1个SNP与日增重在全基因组范围内显著相关，1个SNP与肌内脂肪含量在全基因组范围内显著相关，3个SNPs与瘦肉率在全基因组范围内显著相关，TOX3、DLG5和FAM180A、KIF2B分别是影响丫杈猪日增重、肌内脂肪含量和瘦肉率性状的候选基因。本研究结果为丫杈猪的分子育种提供了一定的理论参考价值。