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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2024 VOL.60  >>   Issue(8)   >>  81-86

遗传育种

基于基因组重测序的公猪精液品质候选基因研究

雷润雨;阳文攀;冯越;周佳伟;徐忠;李梓芃;吴俊静;乔木;彭先文;梅书棋;张宇;

作者单位:

1.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室2.华中农业大学动物科学技术学院3.福建傲芯种业科技有限公司

作者简介:

雷润雨(1999-),湖北襄阳人,硕士研究生,主要从事公猪繁殖性状遗传标记挖掘,E-mail:936223722@qq.com

通信作者:

张宇(1989-),河南开封人,博士,助理研究员,主要从事猪经济性状遗传标记挖掘,E-mail:arthas_54@126.com0

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摘要
闭合
本研究基于某企业公猪站172头纯种大白猪10 316条精液品质记录,分别针对精液体积、精液密度、有效精子密度、精子活力、精子畸形率以及直线运动比例进行统计分析,绘制每种性状的分布情况。相关性分析发现,精液体积与精液密度呈负相关,精子活力与直线运动比例呈正相关、与畸形率呈负相关。进一步分别选取精液体积性状极端高和极端低的10个样品,提取基因组DNA,进行15×全基因组重测序,共获得高质量SNPs和InDels 11 400 036个。以10 kb为window、5 kb为步长进行遗传分化系数(Fixation Index,Fst)分析,以0.1%的window为阈值,筛选精液体积高低组的极端分化区域,共获得4.43Mb的区域,包含142个候选基因。利用David工具进行GO富集分析,结果表明候选基因主要参与细胞分裂(GO:0051301)、白细胞运动(GO:1903238)、信号转导(GO:0007165)以及受体聚集(GO:0043113)等生物学过程。其中CDK6、CDK13、CDK14、STAG1和TNKS等基因主要参与细胞分裂过程,且均有与精子质量相关的报道,可作为影响公猪精液品...
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033