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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2024 VOL.60  >>   Issue(8)   >>  255-261

遗传育种

伍隍猪线粒体基因组构建与进化分析

王萌;杨祎挺;甘麦邻;李永红;沈林園;朱砺;

作者单位:

1.四川农业大学动物科技学院,农业农村部畜禽生物组学重点实验室2.四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室3.四川永鑫农牧集团股份有限公司

作者简介:

王萌(1999-),男,四川达州人,硕士研究生,主要从事猪遗传育种与繁殖研究,E-mail:843181967@qq.com

通讯作者:

沈林園(1987-),男,四川广安人,副教授,主要从事猪遗传育种与繁殖研究,E-mail:shenlinyuan0815@163.com;

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摘要
闭合
伍隍猪是四川省资阳市伍隍区历史悠久的地方猪品种。本研究首次构建出伍隍猪线粒体基因组全序列,并进一步深入揭示了其mtDNA的结构和特点。研究结果表明,伍隍猪线粒体基因组序列全长为16 730 bp,碱基含量组成为A(34.64%)、T(25.80%)、G(13.36%)、C(26.20%),总共包括13个蛋白编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码控制区(D-loop区)。22个tRNA中,除tRNASer(AGY)因缺少DHU臂外,其余tRNA均可以形成典型的三叶草结构。伍隍猪的D-loop区全长为1 294 bp,包括26个片段长度为10 bp的串联重复序列。基于ClustalW多序列比对分析发现,伍隍猪mtDNA序列和四川省6个地方猪的mtDNA序列之间的同源性达99.9%以上,其中共发现了9处主要的碱基突变位点。使用MEGA 11基于22个国内地方猪品种和国外引进品种的mtDNA序列构建系统进化树,结果发现四川省的4个地方猪品种(雅南猪、内江猪、成华猪、青峪猪)聚集成了一个枝簇,而伍隍猪分布于这一簇以外,这也在一定程度上揭示了伍隍猪mtDNA和四川本土地方猪mt...
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033