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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2024 VOL.60  >>   Issue(8)   >>  290-295

遗传育种

香猪CD9基因结构变异多态性及其对基因表达的影响

梁才康;兰隽儿;孙勇;庞玉莲;黄世会;牛熙;王嘉福;冉雪琴;

作者单位:

1.贵州大学动物科学学院2.贵州大学农业生物工程研究院

作者简介:

梁才康(1991-),男,贵州毕节人,硕士研究生,主要从事动物生物化学与分子生物学研究,E-mail:320477385@qq.com

通信作者:

冉雪琴,贵州贵阳人,教授,主要从事动物生物化学与分子生物学研究,E-mail:rxueq@aliyun.com

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摘要
闭合
通过比较基因组学分析,在香猪白细胞分化抗原9(Cluster of Differentiation 9,CD9)基因中检测到1个长度为315bp的结构变异(Structure Variant,SV)。该SV位于CD9基因的第2内含子中。为了探索CD9-I2-sv315的多态性是否对基因表达有影响,本研究通过在该SV上下游设计特异性引物,通过PCR验证CD9-I2-sv315在大白猪和香猪中的群体分布;采用生物信息学技术分析CD9-I2-sv315区域是否存在影响基因表达的功能元件;采用实时荧光定量PCR方法检测香猪主要组织及不同CD9-I2-sv315基因型之间CD9基因的表达变化。结果表明,香猪群体中CD9-I2-sv315位点检测到2种基因型,分别为DD型和ID型(D为缺失基因,I与参考基因一致),其中D等位基因频率为84.5%;大白猪群体中存在3种基因型,II型、ID型和DD型,D等位基因频率为55%。本文比较了香猪主要组织中CD9基因的表达量,得出肺组织的表达量最高。生物信息学分析提示CD9-I2-sv315区域中包含一个短散在元件(Short Interspersed Ele...
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033