全国中文核心期刊
中国科技核心期刊
中国农林核心期刊
中国科学引文数据库 ( CSCD ) 来源期刊
R C C S E 中国权威学术期刊 ( A+ )
中国学术期刊综合评价数据库来源期刊
中国学术期刊 ( 网络版 ) 来源期刊
中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2022 VOL.58  >>   Issue(8)   >>  113-120

遗传育种

使用GWAS和Meta-GWAS鉴定与猪甘油三酯含量相关候选基因

韦怡林;张力戈;张松源;詹凤婷;李秀领;乔瑞敏;韩雪蕾;李新建;王克君

作者单位:

河南农业大学动物科技学院

作者简介:

韦怡林(1998-),女,河南洛阳人,硕士,主要从事动物遗传育种与繁殖研究,E-mail:m15824926265@163.com;

通讯作者:

*王克君,主要从事地方遗传资源保护与开发利用研究,E-mail:wangkejun.me@163.com;

PDF
219
引用
在线阅读
摘要
闭合
本实验旨在挖掘影响猪甘油三酯(TG)含量的有效SNP位点以及候选基因,为生产优良猪肉的选育工作提供理论依据。收集Beadchips 60K SNP芯片分型莱芜猪、二花脸猪和杜洛克×(长白×约克郡)(DLY)群体共1 256头猪的数据,并运用FarmCPU模型对1 256头猪的TG含量进行全基因组关联分析(GenomeWide AssociationStudy,GWAS)及Meta-GWAS分析。GWAS分析结果显示:共检测到32个与TG含量相关的SNP位点,其中莱芜猪中有6个(P<1.8×10-5),二花脸猪中有8个(P<1.8×10-5),DLY中有18个(P<1.8×10-5);Meta-GWAS分析结果显示:发现2个与TG含量相关的新SNP位点;并利用Ensembl数据库,在显著SNP位点上下游0.5 Mb区域内进行基因鉴定,一共发现8个与TG含量调控有关的候选基因,其中在莱芜猪中发现的基因为PDCD6IP;在二花脸猪中发现的基因为CD24、ADGRF5和ADAMTS5;在DLY中发现的基因为DMRTA1、RPS6、TPP2、TEX36。本实验结果将会为解析猪的生长发育以及调控猪的TG含量提供思路。
参考文献
展开
相关文献
展开

期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033