全国中文核心期刊
中国科技核心期刊
中国农林核心期刊
中国科学引文数据库 ( CSCD ) 来源期刊
R C C S E 中国权威学术期刊 ( A+ )
中国学术期刊综合评价数据库来源期刊
中国学术期刊 ( 网络版 ) 来源期刊
中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2022 VOL.58  >>   Issue(8)   >>  94-99

遗传育种

大白猪繁殖性状全基因组关联分析

张宇;周佳伟;吴俊静;乔木;徐忠;李梓芃;彭先文;梅书棋

作者单位:

动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

作者简介:

张宇(1989-),男,博士,助理研究员,主要从事猪遗传育种研究,E-mail:arthas_54@126.com;

通讯作者:

*梅书棋(1971-),男,湖北武穴人,硕士,二级研究员,主要从事猪遗传育种研究,E-mail:smsqlfe@163.com;

PDF
494
引用
在线阅读
摘要
闭合
本研究利用全基因组关联分析(GWAS)挖掘与大白猪总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和健仔数(NHP)相关的候选基因。选择1 100头大白猪为实验材料,通过提取耳尾组织样DNA并利用“中芯一号”芯片进行基因型分型,采用PLINK v1.9对获得的基因型数据进行质控后用于GWAS研究。rMVP软件对每个SNP与性状做关联分析,确定出显著位点。结果表明:对于TNB性状共有3个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著;NBA性状共有4个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著;NHP分析得到18个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著。在上述显著SNPs附近共有23个候选基因,根据基因功能注释推测ESR1、ZP3、YWHAG、HSPB1、MDH2、PCCB是能够影响繁殖性状的重要候选基因。
参考文献
展开
相关文献
展开

期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033