瘤胃是成年奶牛的主要消化吸收器官，能够降解粗饲料、非蛋白氮等饲料。微生物大量存在于瘤胃，其组成、丰度、功能和代谢会影响奶牛的产奶和饲料转化效率等性状。本文介绍了宏基因组技术在微生物基因组组装、瘤胃微生物调控奶牛生产性状形成机制以及微生物新酶发现的研究进展，展望了奶牛瘤胃宏基因学发展前景，旨在为解析奶牛重要性状遗传与调控机制提供新思路。