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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2024 VOL.60  >>   Issue(1)   >>  217-222

遗传育种

茶花鸡2号IFN-α基因克隆及生物信息学分析

刘琛;何永江;豆腾飞;杨明华;潘洪彬;赵素梅;李永能;黄英

作者单位:

1. 云南农业大学动物科学技术学院/云南省动物营养与饲料重点实验室2. 云南农业大学组织部

作者简介:

刘琛(1999-),男,云南昆明人,在读硕士研究生,主要从事动物营养与饲料科学研究,E-mail:lc1473301117@126.com;

通信作者:

*李永能(1976-),男,云南师宗人,硕士,高级实验师,主要从事动科科学研究,E-mail:lyn77@vip.sina.com;*黄英,女,云南陆良人,硕士高级实验师,主要从事动物营养与饲料科学研究,E-mail:410457491@qq.com;

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摘要
闭合
本研究旨在克隆茶花鸡2号α干扰素基因(IFN-α)CDS区序列并进行生物信息学分析,为后续研究IFN-α基因对茶花鸡2号免疫功能的影响提供参考。以茶花鸡2号为实验对象设计IFN-α引物,提取总RNA,反转录PCR扩增并克隆其编码区序列,进行生物信息学分析。结果显示茶花鸡2号IFN-α基因CDS序列全长582 bp,IFN-α蛋白等电点5.05,平均疏水指数-0.514,为酸性亲水蛋白,且存在信号肽和1个跨膜区,主要定位于细胞核。IFN-α蛋白被4个N糖基化位点、5个O糖基化位点和20个磷酸化位点修饰,主要由α-螺旋与无规卷曲构成。茶花鸡2号与固始鸡、海兰鸡、惠阳胡须鸡、罗曼鸡和乌骨鸡的氨基酸同源性分别为95.9%、97.9%、97.9%、97.9%和95.9%。IFN-α蛋白与IRF7、IFNAR1、IFNAR2和IFNK等蛋白存在互作关系。本研究结果可为进一步探讨IFN-α基因在茶花鸡2号病毒疾病防治中的作用提供理论依据。
参考文献
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033