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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2024 VOL.60  >>   Issue(2)   >>  226-230+237

遗传育种

miR-370-3p在绵羊中的表达、生物信息学分析与靶基因预测

王丹;张双双;贾琪;张新玉;付佳棋;张立春;孙福亮

作者单位:

1. 延边大学农学院2. 吉林省农业科学院动物生物技术研究所

作者简介:

王丹(1999-),女,硕士研究生,研究方向:动物毛囊发育基因表达调控,E-mail:1604257036@qq.com;

通讯作者:

*张立春(1977-),男,博士,研究方向:动物生物技术,E-mail:zhang_lich@163.com;*孙福亮(1978-),男,博士,研究方向:动物毛囊发育基因表达调控,E-mail:flsun@ybu.edu.cn;

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摘要
闭合
本研究以新吉细毛羊和小尾寒羊为实验动物,用实时荧光定量PCR检测miR-370-3p在绵羊不同组织中的表达变化;利用Mega11.0对miR-370-3p进行序列分析,并构建进化树;利用miRBase对脊椎动物的miR-370-3p序列进行检索,使用Ensembl数据库对miR-370-3p进行定位;利用在线网站预测miR-370-3p的靶基因,并进行GO、KEGG分析。组织表达结果显示,miR-370-3p在2种绵羊1月份和10月份的皮肤组织中均存在显著差异;在2种绵羊同组织间均存在显著差异。miR-370-3p序列主要存在于哺乳动物,且在不同物种间高度保守;miR-370-3p共有315个靶基因;GO分析结果显示靶基因主要富集在蛋白质的自磷酸化、细胞核与细胞质的运输、神经元凋亡过程等方面;KEGG通路分析表明靶基因主要富集到MAPK信号通路、寿命调节通路和细胞内吞作用等,其中多个与毛囊生长发育相关的基因富集到相关通路之上。绵羊miR-370-3p在皮肤组织存在时空表达差异,在各组织间广泛表达,可能通过靶向MAPK信号通路及寿命调节等通路参与调控毛囊的生长发育。
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033