为从分子水平上探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构、遗传背景及与我国北方其他黄牛品种间的遗传关系，本研究对265头柴达木牛个体mtDNA D-loop区全序列进行测定，并从GenBank下载了我国北方13个其他地方黄牛品种（群体）的206条相应序列，以雷州牛为参照对15个黄牛品种（群体）的480条mtDNAD-loop区序列进行综合分析。结果表明：柴达木牛mtDNAD-loop区核苷酸序列长度在909～916bp之间，排除插入/缺失后多序列比对分析共检测到86个核苷酸多态位点，包括15个单一多态位点和71个简约信息位点；依据序列间核苷酸变异在柴达木牛中共确定了56种单倍型。遗传多样性分析表明，柴达木牛具有丰富的母系遗传多样性，其单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.957 3±0.004 1和0.161 6±0.080 5；品种内大柴旦、茫崖、都兰3个群体相比乌兰、格尔木2个群体具有更高的遗传变异，母系遗传多样性水平更高。遗传分化分析表明，柴达木牛品种内群体间存在不同程度的遗传分化（FST=0.020 2～0.192 8），但各群体间分化程度整体水平较高，部分群体间达到中等及中等以上分...