以180日龄的大白猪（n=6）与巴马香猪（n=6）为研究对象，屠宰后测定肌内脂肪、肉色、嫩度、pH、滴水损失等肉质性状，采集背最长肌组织提取总RNA，利用RNA-Seq技术鉴定大白猪和巴马香猪背最长肌组织中的表达差异基因及其功能富集通路。结果发现，以大白猪为对照组，在巴马香猪和大白猪背最长肌组织中共鉴定到5 037个差异表达基因，其中有3 326个上调表达基因，1 711个下调表达基因。经过KEGG富集通路分析，发现巴马香猪和大白猪一共有168条显著富集通路，其中上调DEGs有92条富集路径，下调DEGs有76条富集路径；GO功能分析中上调表达基因富集到BP有3 058条、CC有413条、MF有559条，下调表达基因富集到BP有3 050条、CC有415条、MF有557条。大白猪与巴马香猪肉色的亮度L在45min时呈极显著差异；大白猪与巴马香猪之间的肌内脂肪、水分均呈现显著差异。本文对大白猪与巴马香猪肌内脂肪含量进行转录组测序分析，初步认为CAPN3、MTM1、TMOD4等基因在巴马香猪肉质中发挥重要作用。