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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2024 VOL.60  >>   Issue(2)   >>  150-156

遗传育种

苏姜猪背膘组织发育过程中lncRNA的差异表达谱分析

张亚琴;倪黎纲;谢欣怡;徐盼;朱淑斌;高慧珍;张君胜

作者单位:

1. 江苏农牧科技职业学院2. 山东农业大学生命科学院

作者简介:

张亚琴(1988-),女,江苏如皋人,硕士,讲师,专业动物遗传育种与繁殖,主要从事生猪教学研究工作,E-mail:121290179@qq.com;

通讯作者:

*倪黎纲,男,江苏泰州,博士,主要从事地方猪资源保护与开发利用的研究,E-mail:117334955@qq.com;

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摘要
闭合
本实验旨在研究lncRNA在地方品种苏姜猪不同生长发育阶段的差异表达及其与脂肪沉积的关系。选择1、3、6、8月龄(M1、M3、M6、M8)4个生长时期苏姜猪背膘组织进行转录组测序,分别筛选4个阶段差异表达lncRNA,对4个阶段共同差异表达lncRNA进行顺式和反式靶基因预测,并对其进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证转录组测序结果。本研究共鉴定出134个共同差异表达lncRNA,功能富集显示,不同阶段共同差异表达lncRNA的靶基因显著富集于基因表达、脂肪代谢、细胞核及发育过程等GO条目中;KEGG分析表明,共同差异表达lncRNA的靶基因主要富集在胰岛素信号通路、MAPK信号通路、钙沉积通路、脂肪酸生物合成、PI3K-Akt信号通路和磷脂酶D信号通路等。通过qRT-PCR验证发现,定量结果和测序结果基本一致。本研究分析了苏姜猪在不同生长阶段lncRNA的表达谱差异,为进一步研究lncRNA在苏姜猪不同生长阶段脂肪发育的调节机制奠定了重要基础。
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033