本研究旨在筛查黎平牛精子特异性阳离子通道蛋白1(Cation Channel Sperm-Associated 1,CatSper1)基因的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs），并通过生物信息学方法预测其对蛋白质结构与功能的潜在影响，评估其作为影响精子功能候选位点的可能性，为后续探究其与精液品质的关联提供基础。采用PCR与Sanger测序对66头黎平牛CatSper1基因编码区进行多态性检测，结合生物信息学分析其mRNA及蛋白结构。在基因外显子1上，发现2个错义突变：g.44105561G>A(p.Ser71Gly)和g.44105762C>G(p.Arg138Gly)，均呈中度多态且符合Hardy-Weinberg平衡。CatSper1基因mRNA结构预测显示p.Arg138Gly突变引起自由能及稳定性改变，p.Ser71Gly影响较小。CatSper1蛋白结构分析表明错义突变p.Arg138Gly导致等电点降低、电荷分布改变及二级结构改变（α-螺旋减少、无规卷曲增加）；错义突变p.Ser71Gly未引起明显结构变化。蛋白互作网络预测显示，CatSper1与EFCAB9、CACNA1G等关键调控蛋白存在相互作用。尽管错义突变p.Ser71Gly与p.Arg138Gly对蛋白功能的影响被预测为“中性”变异，但错义突变p.Arg138Gly可能通过调控mRNA稳定性及构象影响精子功能。本研究首次系统报道了黎平牛CatSper1基因的特异性SNPs及其对mRNA和蛋白结构的潜在影响机制，为该品种繁殖力改良和标记辅助选择提供了理论依据。