试验旨在比较桃源鸡与白羽肉鸡肠道真菌群落的发育规律。试验共饲养雌雄混合的健康鸡480只，其中桃源鸡240只，饲养至105日龄；白羽肉鸡240只，饲养至56日龄。分别在桃源鸡的1、7、14、21、28、42、56、77、105日龄和白羽肉鸡的1、7、14、21、28、42、56日龄随机挑选健康个体，每个日龄取6只，共采集384份肠道食糜样品。两品种均在标准条件下饲养，白羽肉鸡饲养至56日龄，桃源鸡饲养至105日龄，采集十二指肠、空肠、回肠和盲肠样品，采用高通量ITS测序技术对真菌群落进行系统分析。结果显示：1）在α多样性方面，白羽肉鸡群落丰富度在中期达到峰值后趋于稳定，而桃源鸡在后期显著增加；2)β多样性分析表明，白羽肉鸡在较短周期内各肠段群落结构快速分化并趋于稳定，而桃源鸡则呈现逐步演替和阶段性重叠，仅回肠随龄分化较为明显；3）在群落组成上，两品种均以子囊菌门和担子菌门为主，但属水平差异显著，白羽肉鸡以Aspergillus、Trichosporon为主，而桃源鸡盲肠中Fusarium、Alternaria等属比例较高；4）在定植规律上，白羽肉鸡核心类群长期稳定存在，新定殖类群较少，而桃源鸡在维持核心类群的同时，中后期引入更多新定殖类群。结果提示，白羽肉鸡的肠道真菌群落表现为“快速定殖并趋于稳定”，而桃源鸡则呈现“缓慢演替并在后期增强”的特征，说明品种遗传背景对鸡肠道真菌群落发育具有重要影响。