年出雏数是评价鸽生产能力的重要指标，本研究拟通过筛选与石岐鸽年出雏数性状相关的分子标记及候选基因，为解析出雏数性状的遗传机制及分子育种提供理论支撑。以石岐鸽3个世代群体作为研究对象，统计每只母鸽的年出雏数，采集血液进行基因组重测序，使用GMAT软件进行全基因组关联分析（GWAS），鉴定与鸽年出雏数性状相关的SNPs位点和候选基因。结果显示，石岐鸽年出雏数平均为16.09只。280个鸽样本测序共产生3 710.96 Gb原始数据，平均测序深度为9.92×，过滤后分别获得1 840 541 115个SNPs位点和272 982 269个InDel位点。GWAS结果共鉴定出42个突变位点与鸽年出雏数性状显著相关，对显著位点进行注释，共鉴定到31个候选基因，其中较为显著的位点主要聚集于第2和10号染色体上，这些区域内注释到MYOM1、CHST9、CDH2、CHDH、CACNA2D3、TXNRD3等候选基因。单倍型分析结果显示，2号染色体上存在1个显著关联的单倍型区块，其中MYOM1基因在显著的block区块中被注释到；10号染色体上存在4个显著关联的单倍型区块，其中CACNA2D3基因在显著的block区块中被注释到。挑选出10个代表性SNPs与鸽年出雏数数据进行关联性分析，其中大部分SNPs与鸽年出雏数性状呈显著或极显著相关。本研究利用GWAS方法筛选出MYOM1、CDH2、CHDH、CACNA2D3、TXNRD3等基因为鸽年出雏数性状的候选基因，研究结果为鸽出雏能力的分子标记辅助选育提供了理论支撑。