本研究旨在通过转录组和蛋白组学联合分析，筛选外源性褪黑素（Melatonin, MT）诱导绒山羊绒毛生长发育的候选基因，并探究其分子调控机制。试验选取6只24月龄的雌性半同胞罕山白绒山羊，随机分成对照组和埋植组，每组3个生物学重复，分别采集绒山羊自然长绒的7月（D7）与外源MT诱导提前长绒的5月（M5）及夏季绒毛脱落并伴随过冬绒毛快速生长的9月（M9）皮肤组织样品，通过RNA-Seq和LabelfreeDIA蛋白组定量分析筛选差异表达基因（DEGs）和差异丰度蛋白（DAPs），并对其进行系统的功能富集分析和蛋白互作（PPI）网络分析。结果显示，在M5 vs D7组中共鉴定到379个DEGs和98个DAPs，富集分析显示，DEGs和DAPs显著富集到补体和凝血级联反应、ECM-受体相互作用、PI3K-Akt信号等通路，并筛选出COL1A1、COL1A2、KRTAP11-1、PCOLCE、THBS1、KRT82、SPARC、KRT35这8个关键基因；在M9 vs D7组中共鉴定到335个DEGs和137个DAPs，并显著富集在补体和凝血级联、PPAR信号通路、ECM-受体相互作用等通路，筛选出COL1A1、KRTAP11-1、KRT35、SPON1、S100A9、COL4A1、COL1A2这7个关键基因，其中COL1A1、COL1A2、KRT35和KRTAP11-1在2组中均为与绒毛生长相关的关键候选基因。本研究筛选出的相关候选基因及信号通路，为解析MT调控绒毛生长节律提供了理论依据。