中草药含有多糖、皂苷、黄酮类等多种生物活性成分，可作为一种饲用抗生素替代物应用于动物生产。微生物发酵中草药可促进中草药中活性成分的释放、生成新的生物活性物质、降低中草药的毒副作用、增加中草药中微生物含量，能够发挥微生物和中草药的协同作用，从而有效改善动物肠道菌群、提高机体免疫力和促进动物生长。本文主要从微生物发酵中草药的优势、常用的微生物菌种和发酵工艺以及微生物发酵中草药调控动物肠道健康的作用机制等方面进行综述，并对微生物发酵中草药的前景进行了展望，以期为中草药在畜禽养殖中的研究和应用提供参考。