肌内脂肪含量（IMF）很大程度上决定了猪肉的风味。本研究以278头硒都黑猪为对象，通过DNA混池测序法，筛选鉴定到PRKN基因7个SNPs位点，即g.116643 A>G、g.266350 G>A、g.415961 G>A、g.603890C>T、g.749080 A>C、g.1017762 G>A和g.1023638 C>T。通过关联分析发现这7个SNPs位点均与肌内脂肪含量显著相关，连锁不平衡分析结果显示，这7个SNPs位点存在较强关联性（r 2 >0.88），对数量较多的4种单倍型组合进行了IMF关联分析，发现单倍型组合AGGCAGCAGGCAGC个体IMF最高。组织表达谱结果显示，PRKN基因在猪背脂组织中高表达。蛋白互作分析表明，PRKN基因可能通过PINK1-PRKN线粒体自噬通路调控脂质沉积。本研究结果可为猪肉质性状的遗传改良提供分子标记。