本研究旨在探讨高、低肌内脂肪含量猪背最长肌肉品质及转录组特征，为猪肉品质改良和肌内脂肪沉积相关候选基因筛选提供参考。测定高、低肌内脂肪含量组猪胴体性状、肉色、pH、滴水损失和肌内脂肪含量；利用RNA-seq技术分析背最长肌差异表达基因、功能富集、SNP位点、可变剪接及基因共表达网络。结果发现，2组多数胴体性状和常规肉品质指标差异不显著，高肌内脂肪组肩部最厚处膘厚显著升高，肌内脂肪含量极显著高于低肌内脂肪组。转录组分析共筛选到174个差异表达基因，其中上调82个、下调92个。功能分析显示，差异基因涉及脂质代谢、碳水化合物代谢和氨基酸代谢等过程，基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis,GSEA）显示脂肪酸响应相关基因在高肌内脂肪组富集。SNP、可变剪接和WGCNA分析进一步显示2组在转录组变异、剪接模式和共表达模块上存在差异。高、低肌内脂肪含量猪背最长肌存在转录组水平差异，脂肪酸响应通路及相关可变剪接事件可能参与肌内脂肪沉积调控。