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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2026 VOL.62  >>   Issue(08)   >>  136-143

遗传育种

基于全基因组重测序的枞阳黑猪选择信号分析

吴旭东;修达郅;倪文亮;张亚兰;黄艺敏;周林妹;李何君;鲍马羊;赵乐乐;殷宗俊;

作者单位:

1.安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,安徽省畜禽产品安全重点实验室2.安徽农业大学动物科技学院3.上海农林职业技术学院4.安徽翠平生态农业科技发展有限公司

作者简介:

吴旭东(1994-),男,博士,助理研究员,主要从事猪生产及遗传育种研究,E-mail:white_wxd@163.com;

通信作者:

*赵乐乐(1987-),女,博士,讲师,主要从事动物遗传育种研究,E-mail:lelezhao2011@163.com;;*殷宗俊(1967-),男,博士,教授,博士生导师,主要从事动物遗传育种研究,E-mail:yinzongjun@ahau.edu.cn;

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摘要
闭合
枞阳黑猪是安徽省优良的地方猪种资源。为从基因组水平解析其特色性状形成的遗传基础,本研究以194头枞阳黑猪保种场核心群为研究对象,采用1×深度全基因组重测序结合基因型填充策略获得遗传变异信息,并分别以亚洲野猪和3个商业猪种(杜洛克猪、长白猪和大白猪)为参考群体,联合使用群体遗传分化指数(Fst)、核苷酸多样性比值(θπratio)和跨群体复合似然比检验(XP-CLR)3种方法开展全基因组选择信号扫描。结果如下:以亚洲野猪为参考群体时,共鉴定到395个受选择区域,注释到52个候选基因;以3个商业猪种为参考群体时,共鉴定到64个受选择区域,注释到20个候选基因。功能富集分析显示,相关基因主要涉及免疫应答、炎症调控、脂质代谢、细胞增殖及生长发育等生物学过程,其中MLH1、TAGLN2和TBP可能是与枞阳黑猪免疫、繁殖性能相关的重要候选基因。综上,本研究从全基因组层面揭示了枞阳黑猪在地方适应性、繁殖力、肉品质及免疫抗逆性等方面可能的遗传基础,可为该品种的种质资源保护、分子标记开发及后续分子育种提供理论依据和数据支撑。
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033