枞阳黑猪是安徽省优良的地方猪种资源。为从基因组水平解析其特色性状形成的遗传基础,本研究以194头枞阳黑猪保种场核心群为研究对象,采用1×深度全基因组重测序结合基因型填充策略获得遗传变异信息,并分别以亚洲野猪和3个商业猪种(杜洛克猪、长白猪和大白猪)为参考群体,联合使用群体遗传分化指数(Fst)、核苷酸多样性比值(θπratio)和跨群体复合似然比检验(XP-CLR)3种方法开展全基因组选择信号扫描。结果如下:以亚洲野猪为参考群体时,共鉴定到395个受选择区域,注释到52个候选基因;以3个商业猪种为参考群体时,共鉴定到64个受选择区域,注释到20个候选基因。功能富集分析显示,相关基因主要涉及免疫应答、炎症调控、脂质代谢、细胞增殖及生长发育等生物学过程,其中MLH1、TAGLN2和TBP可能是与枞阳黑猪免疫、繁殖性能相关的重要候选基因。综上,本研究从全基因组层面揭示了枞阳黑猪在地方适应性、繁殖力、肉品质及免疫抗逆性等方面可能的遗传基础,可为该品种的种质资源保护、分子标记开发及后续分子育种提供理论依据和数据支撑。