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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2026 VOL.62  >>   Issue(08)   >>  128-135

遗传育种

美系大白猪达120 kg体重日龄及背膘厚的全基因组关联分析

吴智超;谭涛;周佳伟;赵雨;滕艺;徐忠;孙华;黄生强;

作者单位:

1.湖南农业大学动物科学技术学院2.岳麓山实验室3.动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

作者简介:

吴智超(2001-),男,山东泰安人,硕士研究生,主要从事动物遗传与育种研究,E-mail:2721008738@qq;

通信作者:

*黄生强(1968-),男,湖南郴州人,博士,副教授,主要从事动物遗传育种与繁殖研究,E-mail:hsq07@126.com;

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摘要
闭合
本研究利用全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)解析大白猪达120 kg体重日龄(Age at 120 kg Body Weight,AGE120)和120 kg体重活体背膘厚(Live Backfat Thickness at 120kg Body Weight,BF120)的遗传基础,挖掘显著SNP及候选基因,估计性状遗传力,为猪生长性状的遗传改良提供理论基础。以1 244头大白猪为研究对象,采用147 973个高密度SNP标记。GREML估计结果显示,AGE120的遗传力为0.317,属于中等遗传力性状;BF120的遗传力为0.546,属于中高遗传力性状。比较GLM、MLM和FarmCPU模型对AGE120和BF120的关联分析效果,结合候选基因注释、功能归类、PigBiobank PheWAS分析和GREML方法完成显著区域解析和遗传力估计。FarmCPU模型共检测到3个与AGE120全基因组显著相关的SNP,分布于SSC6、SSC15和SSC16;检测到5个与BF120全基因组显著相关的SNP,分布于SSC1、SSC6、SSC11和SSC13。注释得到SLC44A5、LHX8、TYW3、CRYZ、ERICH3和DOCK10等与AGE120相关的基因,TJP1、ADGRL4、IFI44、IFI44L和PTGFR等与BF120相关基因。PheWAS分析显示,TYW3与平均日增重和达目标体重日龄等生长及胴体性状存在关联信号,ADGRL4与背膘厚、眼肌深度等胴体和生长性状存在关联信号。本研究筛选获得的显著SNP和候选基因可为美系大白猪AGE120和BF120的遗传解析提供参考,其中TYW3和ADGRL4可作为后续功能验证的重点候选基因。
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033