猪的繁殖性状属于低遗传力性状,采用传统方法育种进展缓慢。本研究采用全基因组关联分析(Genome-wide Association Studies,GWAS)筛选大白猪第1~3胎总产仔数(Total Number of Born,TNB)候选基因,解析其遗传机制。结果显示,Turkey显著性检验发现1~3胎总产仔数两两之间差异极显著。共鉴定出1个影响TNB性状的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)和1个精细定位的数量性状基因座(Quantitative Trait Locus,QTL)。候选基因注释和GO分析揭示了与第二胎TNB相关的基因在调节R结合(GO:0061980)和细胞表面(GO:0061980)通路中富集。对候选SNP位点基因型进行方差分析显示,位点基因型对TNB性状影响极显著,且相比于G基因,A为优势基因,多重比较结果显示,AA和GG基因型、AG和GG基因型之间差异均显著,该SNP位点基因型对方差的解释率为7.29%,也验证了该位点确实对TNB性状具有较大贡献。研究结果强调了GWAS在检测复杂性状遗传变异方面的重要性,为理解大白猪繁殖性状的遗传基础提供了新的见解,并为未来的遗传改良提供了潜在的分子标记。