猪生长激素（Growth Hormone,GH）和胰岛素样生长因子-1(Insulin-like Growth Factor-1,IGF-1)基因通过神经内分泌生长轴协同调控肌肉发育与脂肪代谢。本研究选择健康且体型相似的杜洛克猪、长白猪、烟台黑猪、八眉猪各50头，通过DNA混合池扩增并且进行直接测序的方法筛选出4个猪种的GH基因外显子2和IGF-1基因外显子4的SNP位点，并对这些位点的序列结构以及理化特性改变进行分析。结果显示，在GH外显子2上，杜洛克猪和八眉猪存在5个SNP位点（c.26C>T、c.39C>T、c.65G>A、c.74G>A、c.114C>T），长白猪和烟台黑猪存在6个SNP位点（c.26C>T、c.39C>T、c.65G>A、c.74G>A、c.75C>A、c.114C>T），其中位点c.26C>T、c.65G>A、c.74G>A分别导致第9、22、25位氨基酸由丙氨酸A变为缬氨酸V、精氨酸R变为谷氨酰胺Q、脯氨酸P变为天冬氨酸D；在IGF-1基因外显子4上，杜洛克猪、八眉猪、烟台黑猪均存在1个SNP位点（c.410A>G），长白猪不存在SNP位点，表明猪GH基因多态性较高而IGF-1基因多态性较低。序列分析表明，GH外显子2的6个SNP位点均导致mRNA二级结构发生改变，c.26C>T、c.39C>T、c.75C>A使自由能减小，而c.65G>A、c.74G>A、c.114C>T使自由能增大；IGF-1外显子4的SNP位点c.410A>G使其mRNA二级结构自由能增大。GH外显子2和IGF-1外显子4编码蛋白的保守性较高。GH外显子2上的SNP位点c.65G>A和c.74G>A对其编码蛋白理化特性影响较大，而仅有位点c.26C>T使蛋白质二级结构组分比例发生改变。研究结果为猪生长发育相关分子育种提供了参考。