全国中文核心期刊
中国科技核心期刊
中国农林核心期刊
中国科学引文数据库 ( CSCD ) 来源期刊
R C C S E 中国权威学术期刊 ( A+ )
中国学术期刊综合评价数据库来源期刊
中国学术期刊 ( 网络版 ) 来源期刊
中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2026 VOL.62  >>   Issue(07)   >>  168-176

遗传育种

奶牛隐性乳房炎多基因风险评分模型的构建与性能评估

赖婉仪;陶欣月;李欣;陈昊天;陈思倩;余文莉;俞英;

作者单位:

中国农业大学动物科学技术学院2.石家庄天泉良种奶牛有限公司

作者简介:

赖婉仪(2003-),女,福建漳州人,硕士生,主要从事奶牛抗病育种研究,E-mail:laiwanyi1347219997@163.com;;陶欣月(2000-),女,天津人,硕士生,主要从事奶牛抗病育种研究,E-mail:a1076146543@163.com;

通信作者:

*余文莉,女,湖北黄冈人,博士,研究员,主要从事胚胎生物技术研发与推广,E-mail:lixin1016123@126.com;;*俞英,女,云南陆良人,博士,教授,主要从事动物抗病分子育种及表观遗传调控机理研究,E-mail:yuying@cau.edu.cn;

PDF
46
引用
在线阅读
摘要
闭合
奶牛乳房炎是一种在全球奶牛产业中造成巨大经济损失的复杂疾病,其中隐性乳房炎的发病率为25%~65%,临床乳房炎的发病率约为5%。基于分子生物学、生物信息学技术筛选关键基因及位点,构建性能最优的多基因风险评分(Polygenic Risk Score,PRS)模型,对奶牛乳房炎的抗性遗传育种具有重要意义。本研究基于1 097头中国荷斯坦牛尾静脉血,提取基因组DNA,使用奶牛乳房健康分子检测芯片(Chinese Cow's SNPs Chip-I,CCSC-I)完成基因分型,结合相应奶牛群体改良(Dairy Herd Improvement,DHI)数据报告中的乳房健康指标——体细胞数(Somatic Cell Count,SCC)及体细胞评分(Somatic Cell Score,SCS),通过单位点关联分析和PRSice-2筛选有意义的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点,完成PRS模型构建,并利用10折分层重复交叉验证完成PRS模型性能评估。分析结果显示:在中国荷斯坦牛群体中,PRS的预测能力优于模型中的相应SNPs,且1-PRS-2、1-PRS-8、2-PRS-10、3-PRS-4的高、低PRS组间SCC、SCS差异显著或极显著,预测能力突出。基于以上结果认为,1-PRS-2、1-PRS-8、2-PRS-10、3-PRS-4具有较高的泛化能力和预测能力。本研究结果为未来奶牛乳房炎抗性精准选育提供了有力的科学依据。
参考文献
展开
相关文献
展开

期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033