本研究旨在挖掘ACACA、PCK1和LEPR基因中与大白猪活体背膘厚及眼肌面积显著关联的SNP位点，为猪肉质性状的精准遗传改良提供关键靶向位点。试验选取80头5月龄、体重80～100 kg的大白猪，超声仪测量其活体背膘厚和眼肌面积。先采用PCR技术扩增ACACA、PCK1和LEPR基因部分外显子区序列，再通过测序分析该区域的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP），最后利用生物信息技术预测突变后的RNA和蛋白质二级结构。结果表明：在ACACA、PCK1、LEPR基因中共检测到5个SNP位点：ACACA:rs344657885G>A、LEPR:rs704399896C>T、PCK1:rs343196765A>C、PCK1:rs331782052A>G、LEPR:rs45435516A>G。遗传多样性分析显示5个位点均处于Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。其中，PCK1:rs331782052A>G位点的GG型背膘厚大于AG型（P>0.05）,GG型的眼肌面积大于AG和AA型（P<0.05）。此外，生物信息学预测出突变导致PCK1、LEPR的RNA和蛋白质二级结构发生明显改变。PCK1的rs331782052A>G位点与大白猪活体背膘厚和眼肌面积显著相关，可作为分子标记用于高瘦肉率大白猪的早期选育。