本试验旨在探究相同饲养条件下不同绵羊品种（白萨福克羊、无角道赛特羊、湖羊和小尾寒羊）的瘤胃菌群特征，为分析宿主遗传与瘤胃微生物群的互作机制奠定基础。随机选取同龄、体况良好的不同品种2岁成年母羊20只，其中白萨福克羊、无角道赛特羊、湖羊和小尾寒羊各5只，采集其瘤胃内容物，利用宏基因组学测序技术分析瘤胃菌群组成及功能等特征。结果显示，白萨福克羊的chao1指数高于其他3个品种，simpson指数高于无角道赛特羊，湖羊的chao1指数高于无角道赛特羊和小尾寒羊（P<0.01）。在门水平上，不同绵羊品种瘤胃微生物优势菌门均为拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门，其中白萨福克羊的变形菌门占比高于其他3组（P<0.05）；在属水平上，白萨福克羊的普雷沃氏菌属相对丰度最高，其次为假单胞菌属，其他3个品种的瘤胃微生物优势菌属分别为普雷沃氏菌属、纤维杆菌属和解琥珀酸菌属。物种注释分析显示，比对nt数据库共获得100种差异细菌，其中富集到小尾寒羊的细菌最多共67个；功能比较分析显示，小尾寒羊的细胞过程和信号传导、淀粉氧化酶以及一些未知功能丰度较高。综上所述，白萨福克羊、无角道赛特羊、湖羊和小尾寒羊的瘤胃微生物物种组成及功能既有相似性，也存在一定差异，白萨福克羊瘤胃物种的多样性较高，小尾寒羊差异细菌最多。