本文基于全基因组重测序数据解析枣庄黑盖猪与大白猪的群体遗传结构，并筛选与枣庄黑盖猪重要经济性状相关的基因组选择信号及候选基因。结果表明，枣庄黑盖猪具有稳定且相对独立的遗传背景，主成分分析与群体结构分析均显示其与大白猪显著分化。通过F ST 与XP-CLR联合分析，共鉴定出1 101个受选择区域，主要分布于1、6、8、13号染色体，注释获得282个候选基因，涉及肉质、生长、毛色和免疫等关键性状。QTL数据库比对结果也再次显示，多数选择区域与肉质性状相关的肉色、肌内脂肪、背膘厚及生长和免疫能力等具体指标相关。KEGG与GO功能富集分析显示，候选基因显著富集于调控生长发育、代谢与免疫应答的多条信号通路和生物学过程。研究结果揭示了影响枣庄黑盖猪主要经济性状的基因组区域及相关候选基因，为其种质资源保护与分子育种提供了基础数据。