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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2026 VOL.62  >>   Issue(05)   >>  233-238

遗传育种

猪miR-24-3p的靶基因预测及生物信息学分析

王芳;张冬杰;马红;张天雨;夏彦玲;刘娣;

作者单位:

1.黑龙江省农业科学院畜牧研究所2.黑龙江省农业科学院博士后科研工作站3.东北林业大学野生动物与自然保护地学院

作者简介:

王芳(1990-),女,黑龙江人,博士,助理研究员,研究方向为动物遗传育种与繁殖,E-mail:707587749@qq.com;

通信作者:

*刘娣(1963-),女,吉林人,教授,博士,研究方向为动物遗传育种与繁殖,E-mail:liudi1963@163.com;

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摘要
闭合
为了探究猪miR-24-3p影响精子活力的分子机制,试验采用生物信息学方法对猪miR-24-3p的保守性、转录因子和靶基因进行了研究。首先利用miRbase数据库分析不同物种间miR-24-3p序列的保守性;通过NCBI数据库检索miR-24-3p前体序列信息,然后利用JASPAR和AnimalTFDB在线软件对猪miR-24-3p启动子区转录因子结合位点进行预测;利用TargetScan、miRDB、miRWalk数据库预测猪miR-24-3p的靶基因,利用KOBAS数据库对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果表明:miR-24-3p在不同物种间中高度保守;miR-24-3p存在2条前体序列,ssc-mir-24-1和ssc-mir-24-2前体序列中共同含有STAT3和VDR等转录因子结合位点;3个数据库预测取交集后共得到362个靶基因,这些靶基因主要富集在RNA聚合酶II介导的转录正调控、蛋白质磷酸化、ATP结合、染色质结合、细胞核、细胞质等GO条目和MAPK信号通路中。结果表明猪miR-24-3p可能通过上游转录因子STAT3、VDR和MAPK信号通路共同调控精子活力。
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033