繁殖性状是影响养猪业经济效益的关键因素，其遗传机制解析对猪的遗传改良具有重要意义。本研究以繁殖性能差异显著的340头大白猪和277头杜洛克猪为研究对象，旨在通过选择信号分析鉴定与猪繁殖性状相关的候选基因。利用GGP 50K Porcine v1芯片进行基因分型，结合GTEx面板进行基因型填充和质控。群体结构和多样性分析显示，杜洛克猪与大白猪群体间存在较大遗传分化(群体间分化指数F ST =0.235)，大白猪表现出更高的核苷酸多态性（θπ）和杂合度。采用F ST 、θπRatio和跨群体复合似然比检验（XPCLR）3种方法联合分析，筛选出798个受选择区域（前3%且至少2种方法重叠），注释得到606个候选基因。GO富集分析表明，这些基因显著富集于cAMP介导的信号通路（PDE4B、PDE7B、PDE8A、PDE11A）和卵母细胞成熟（FBXO5、PABPC1L、RLN2）等繁殖相关通路。全表型关联分析（PheWAS）验证了这7个基因与总产仔数及活产仔数等性状存在显著关联。本研究为猪繁殖性状的分子育种提供了重要靶点，并为解析其遗传调控机制奠定了理论基础。