本研究通过微生物定向分离技术，分别从犊牛垫料基质及集约化奶牛养殖场环境样本中筛选获得2株高效纤维素分解菌株（G1、G2，经18S rDNA序列分析鉴定归属于黑曲霉属Aspergillus niger）。为评估菌株的生物学效能，试验组采用双菌株平行接种体系构建油菜秸秆固态发酵模型，以无菌接种组作为空白对照，系统测定发酵产物中中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维的降解率；同步开展液态发酵产酶特性研究，观察其纤维素酶活性变化，最终选出G1菌株作为优势菌种，并命名为黑曲霉FX23。随后对其进行全基因组分析。结果表明：添加黑曲霉FX 23发酵油菜秸秆，中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维的降解率较对照组分别显著提高了6.58%、8.38%，且黑曲霉FX23的纤维素酶、内切葡聚糖酶和中性木聚糖酶活性分别可达到48.22、21.51、0.59 U/mL。全基因组测序分析显示，黑曲霉FX23携带大量降解木质纤维素基因，其中在CAZY家族基因有936个基因编码，包括110个与纤维素酶相关的基因、29个半纤维素酶相关基因和134个木质素相关基因。由此可见，黑曲霉FX 23具有较高的产纤维素酶活性，并且拥有大量编码碳水化合物活性酶的基因，在秸秆降解方面具有较好的应用潜力。