本研究旨在利用全基因组重测序技术分析百子鹅群体的保种效果，为后续百子鹅保种工作提供理论参考。从百子鹅保种场随机选取了15只公鹅、15只母鹅，采集血液样本，进行全基因组重测序，对群体遗传多样性、群体结构、亲缘关系等进行分析。结果表明，30只百子鹅共筛选到12 844 939个SNP位点，平均测序深度7×。群体遗传多样性结果显示，百子鹅群体平均期望杂合度（He）为0.317，平均观测杂合度（Ho）为0.287，平均群体近交系数（F）为0.094，平均多态信息含量（PIC）为0.258。由LD衰减分析可知，最大R 2 值为0.49，衰减距离为116 kb。百子鹅保种群体共检测到193个连续纯合片段（ROH），大部分片段长度集中在1～1.5 Mb，基于ROH值计算得到平均近交系数(F ROH )为0.008。主成分分析结果显示，保种群内部总体呈离散状态。IBS距离矩阵、G矩阵的结果趋势相似，大部分个体亲缘关系较远。综上，济宁保种场的百子鹅群体遗传多样性比较丰富，近交程度较低，保种效果良好。