为剖析先天性僵猪与正常猪在常规生理生化指标上的差别，分析该表型与RUNX2基因甲基化水平的相关性。本研究对不同日龄僵猪及其全同胞对照个体体重进行称重，比较血常规和血清生化指标，分析了多种组织的HE切片。采用重亚硫酸盐测序法（Bisulfite Sequencing PCR,BSP）检测了僵猪和对照个体椎骨、软骨、肌肉和脂肪组织中RUNX2基因CpG岛甲基化水平，通过qRT-PCR测定了RUNX2基因在肌肉和脂肪组织中的表达水平。结果显示，与对照猪相比，先天性僵猪的生长速度极显著慢于对照个体。血常规数据表明，仅90日龄僵猪的平均血小板体积显著高于对照个体。血清生化结果表明先天性僵猪未表现出显著差异。组织切片结果表明，与对照个体相比，先天性僵猪脂肪细胞大小显著减小，其余并未表现出明显的病理性变化。僵猪RUNX2基因CpG岛甲基化水平在椎骨、软骨、肌肉和脂肪中与对照个体相比无显著性差异，但在脂肪组织中的差异接近显著性水平（P=0.06）；该基因在僵猪和对照个体的脂肪和肌肉中mRNA水平无显著差异。结果表明，除生长速度极显著下降外，先天性僵猪并未表现出明显的病理性变化；RUNX2基因的CPG岛甲基化水平并未对先天性僵猪的产生发挥重要作用。