乳房炎是影响奶牛和奶山羊等乳畜生产性能的主要疾病之一，微生物组学、代谢组学、蛋白质组学和基因组学技术为解析其机制提供了关键工具。微生物组学揭示肠道菌群通过肠-乳腺轴调控乳腺健康，发现次级胆汁酸、短链脂肪酸（Short-chain Fatty Acids,SCFAs）等与菌群紊乱相关的标志物。代谢组学筛选出粪便丙酮酸、血清丝氨酸、β-羟基丁酸（β-hydroxybutyrate）等反映炎症与代谢状态的核心标志物。蛋白质组学鉴定出乳汁中壳多糖酶3样蛋白I(Chitinase 3 Like Protein I,CHI3LI)、抗菌肽、血清淀粉样蛋白A(Serum Amyloid Protein A,SAA)等诊断靶点。基因组学挖掘出STAT3、PTK2B等跨物种的抗病候选基因，这些基因通过JAK-STAT、炎症信号通路参与抗性调控。本研究综述了上述4种组学技术在乳畜乳房炎研究中的核心发现，旨在为乳畜亚临床乳房炎型（Subclinical Mastitic,SM）的诊断及抗病筛选体系的建立提供参考。