为了揭示新疆褐牛乳品质特性，本研究采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）技术对新疆褐牛和中国荷斯坦牛的乳样进行代谢组学分析，构建新疆褐牛和中国荷斯坦奶牛乳中代谢物表达谱。通过正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）等多元统计分析方法，筛选出2个品种乳中的显著差异代谢物，并对其进行聚类分析和KEGG通路分析，进一步探讨新疆褐牛乳中特异性表达代谢物及其潜在生物功能和健康效应。研究结果显示，乳中共检测到2 685种代谢物（正离子模式：1 283种；负离子模式：1 402种），其中新疆褐牛乳中含有177种特有的高表达量代谢物，包括亚油酸、亚麻酸、特定游离氨基酸、矿物质和关键代谢物等。与中国荷斯坦牛乳相比，新疆褐牛乳在脂肪酸组成上表现出更高的不饱和度，同时某些游离氨基酸和矿物质的含量也较高。高不饱和脂肪酸有助于降低心血管疾病的风险，高含量的抗氧化物质可以增强人体的抗氧化能力，预防慢性疾病。因此，新疆褐牛乳的特有代谢物特征为其在高端乳制品市场的推广提供了新的方向，从而为新疆褐牛乳的深度开发和产业化应用提供了重要的科学依据。