本研究旨在分析烟台黑猪保种群的遗传多样性和群体结构，为烟台黑猪种质资源保护与利用提供依据。利用50K中芯一号基因芯片对76头烟台黑猪进行SNP分型，并开展群体遗传多样性分析、长纯合片段（Runs of Homozygosity,ROH）分析、亲缘关系分析和聚类分析。结果显示，该烟台黑猪群体的观测杂合度（HO=0.34）略低于期望杂合度（HE=0.37），说明该烟台黑猪群体中部分个体混有一定的其他品种血缘；遗传距离平均值约为0.31，所有公猪被分为7个家系，有些家系公猪数量少，需要留后备公猪；烟台黑猪群体共检测出3 348个ROH，个体ROH的平均长度约为408.31 Mb，近交系数为0.01～0.40，平均近交系数值为0.17，说明该烟台黑猪群体部分个体存在一定程度的近交。本研究表明，该烟台黑猪群体在长期的选育过程中遗传多样性丰富，群体中个别个体存在近交现象，为了确保该群体的优良性状能够延续，可利用芯片分析数据，通过轮回杂交方式，减缓群体近交系数的增长。