为探究柴达木牛线粒体基因组插入/缺失变异，对60头柴达木牛进行了基因组重测序，采用MIA软件提取其线粒体基因组全序列，并采用BioEdit、DnaSP、MEGA等生物信息学软件进行了序列比对分析。结果表明：(1)柴达木牛线粒体基因组序列长度为16 338～16 342 bp,A+T含量和G+C含量分别为60.58%～60.63%和39.37%～39.46%；(2)经与普通牛参考序列（NCBI登录号：AY526085）比对分析，共确定了11个插入/缺失位点，其中7个位点位于D-loop区（m.215＿216insC、m.215＿216insTCC、m.351＿352insC、m.16143delA、m.16200＿16201insA、m.16338＿1insG/T）,1个位于12S rRNA区域（m.583＿584insC）,3个位点位于16S rRNA区域（m.1593＿1594insA、m.1594delA和m.2678＿2679insT）；依据序列间核苷酸插入/缺失变异，共确定了14种单倍型；(3)系统发育分析表明：柴达木牛拥有普通牛和瘤牛2个支系，普通牛支系占比为90%，瘤牛支系...