淮南猪是北方优质本土品种，以其肉质细嫩和适应能力著称；长白猪则以快速生长、高瘦肉率和适合工业化生产广受喜爱。本研究通过Ribo-seq技术和生物信息学分析2种猪在妊娠55天胚胎背最长肌在基因表达和非编码RNA调控上的差异，探讨其对肌肉发育的影响。本研究在2种猪背最长肌中鉴定出920个差异表达基因，涉及氧化还原、代谢及神经调控等通路。本研究进一步筛选出具有翻译潜能的circRNAs和lncRNAs，这些RNA显著富集于TGF-β信号通路、赖氨酸降解等过程，揭示其在肌肉生成、脂肪分布和细胞调控中的潜在作用。淮南猪与肉质相关的基因富集程度较高，而长白猪则体现出快速生长的分子特性。本研究结果为2种猪肉质和生长性能差异提供了分子机制解释，同时提出了可用于品种改良和生产优化的分子标志物，为肉类生产和特色养殖产业提供科学依据。