本研究旨在对鸡主要组织相容复合物（Major Histocompatibility Complex,MHC）基因家族进行生物信息学分析，明确鸡感染马立克氏病毒（Marek's Disease Virus,MDV）和注射羊红细胞（Sheep Red Blood Cells,SRBC）后MHC基因家族成员的表达模式。通过生物信息学工具构建跨物种系统进化树，分析鸡MHC蛋白的理化性质、亚细胞定位、染色体分布、保守结构域、共线性、顺式作用元件，并构建蛋白质互作网络，进行蛋白质三维结构建模。进一步分析鸡感染MDV和SRBC免疫应答后鸡脾脏中MHC基因的表达变化。研究共鉴定出49个鸡MHC基因家族成员，鸡MHC基因均密集分布于第16号染色体的特定区域，与日本鹌鹑亲缘关系最近。共线性分析发现其中存在2次串联重复和片段重复事件。蛋白特性分析发现MHC基因编码的蛋白具有1～2个跨膜结构域，均含有免疫球蛋白超家族保守结构域，且主要定位于内质网和质膜。顺式元件分析发现MHC基因启动子区富含C/EBPα、NF-1等免疫相关调控位点，蛋白质互作网络分析发现BF2为枢纽节点。三维结构建模显示经典MHC I闭合槽结...