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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(10)   >>  264-274

遗传育种

基于多种模型的湖羊生长繁殖性状GWAS分析

孙国欣;李蕴华;李宏政;刘治男;刘占虎;苏日格;雷刚;姜力虎;赵艳红;刘佳森;

作者单位:

1.内蒙古自治区农牧业科学院畜牧研究所2.内蒙古农业大学动物科学学院3.内蒙古草绿农业科技发展有限责任公司

作者简介:

孙国欣(1999-),男,硕士研究生,主要从事动物分子育种研究,E-mail:a2432613041@163.com;

通讯作者:

刘佳森,男,蒙古族,研究员,主要从事动物分子育种与表观遗传调控研究,E-mail:jsliu588@163.com;0

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摘要
闭合
本研究旨在通过全基因组关联分析挖掘与湖羊生长繁殖性状相关的候选基因及位点。采集鄂尔多斯某畜牧场的湖羊个体共396只的血样提取DNA,基于Ovine illumina 50K SNP(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)芯片进行基因分型,根据湖羊个体记录的初生重、断乳重、断奶前平均日增重、产羔数的表型信息,通过R包GAPIT的GLM、MLM、FarmCPU、BLINK模型进行全基因组关联分析。根据得到的显著SNP基于Oar_v4.0绵羊参考基因组进行基因注释,通过GO-KEGG富集分析、NCBI数据库以及查找文献对候选基因进行功能注释。结果发现,对于绵羊的复杂数量性状多位点模型FarmCPU、BLINK比单位点模型GLM、MLM具有更高的检测灵敏度。多个模型共挖掘到2个基因组潜在显著水平与初生重相关的SNP位点,2个基因组潜在显著水平与断乳重相关的SNP位点,8个基因组潜在显著水平与平均日增重相关的SNP位点,8个基因组显著水平与平均日增重相关的SNP位点,1个基因组潜在显著水平与产羔数相关的SNP位点,同时上述位点均达到染色体显著水平。经过基因注释,共...
参考文献
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033