雅江雪牛是由公安格斯牛和母犏牛杂交而成，具有生长快、体格大的优势，但具有雄性不育的特征。为揭示单倍型类群基因在多个关键器官中的蛋白表达及功能，本研究选用雅江雪牛背腰最长肌、肝脏和肾脏组织为研究对象，采用4D-DIA方法测定Y染色体单倍型类群基因在不同主要器官中的蛋白表达量。结果显示：雅江雪牛背腰最长肌（XBY）、肝脏（XG）和肾脏（XS）组织中共检测出6 404种表达蛋白。单倍型类群基因不仅与雅江雪牛的生长速度、体格大小等性状密切相关，还通过编码多种功能蛋白质，在胆固醇代谢、脂肪酸转运、激素调节、糖蛋白稳态及肌肉能量供应等方面发挥着重要作用。其中L8ISP4蛋白是部分胆固醇、脂肪酸、激素和酶等内外源性物质的关键载体；L8IDC7能维持糖蛋白稳态，使糖蛋白正确折叠，并与肌纤维的形成具有重要关系；L8I1G3可以抑制胰岛素产生，保障了对肌肉的供能。此外，还鉴定出了L8HZH7和L8ID97 2种编码蛋白，为高品质肉牛育种的候选分子标记，这与雅江雪牛在实际生产中表现出的肉质优良特性相一致。本研究不仅加深了对雅江雪牛单倍型类群基因功能的认识，也为西藏优良肉牛高原适应性育种提供了研究手段。