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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(9)   >>  157-163

遗传育种

基于全基因组重测序挖掘山羊高繁性状的候选基因

丁虹;孙洪新;刘月;赵志强;董玉玲;杨威;袁立新;

作者单位:

河北省畜牧兽医研究所

作者简介:

丁虹(1998-),女,河北张家口人,助理研究员,硕士,主要从事畜禽遗传资源种质特性挖掘、保存与利用的研究,E-mail:dinghong0203@163.com;

通讯作者:

孙洪新,研究员,E-mail:sdlqshx@126.com;0

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摘要
闭合
本研究对繁殖性能不同的山羊群体进行了全基因组重测序分析,旨在为山羊高繁性状主效基因的挖掘提供理论基础。采集高繁上谷白山羊(29只)和低繁燕山绒山羊(30只)共59只的血液样本,提取DNA对其进行全基因重测序,应用主成分分析(PCA)、系统进化树、群体遗传结构及全基因组扫描(Fst&θπ)等综合分析法确定候选区域,对受选择区域进行KEGG和GO富集分析,以进一步筛选山羊高繁性状候选基因及位点,对候选基因的错义突变位点进行鉴定,随机挑选高繁、低繁山羊各5只,将10个山羊样本的70个扩增产物进行Sanger测序以验证重测序结果。共筛选出21 974个受选择的位点(Top1%Fst&θπ),GO分析显示,差异基因集中在糖基转移酶活性通路、突触膜的组成成分通路和参与形态发生的发育生长通路等(P<0.01);KEGG通路结果显示,差异基因富集于其他类型的O-糖生物合成信号通路、细胞衰老信号通路和近端小管碳酸氢盐再生信号通路等(P<0.01)。共鉴定到7个与繁殖相关的候选基因,共12个SNPs候选位点,包括5个同义突变和7个错义突变。7个错义突变的Sanger测序结果显示...
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033