藏猪作为我国重点保护的高原型猪种,在长期的繁衍和进化过程中形成了适应高原低氧环境的能力,并成为研究高原低氧适应机制的模式动物。缺氧诱导结构域家族成员2A(Hypoxia Inducible Domain Family Member 2A,HIGD2A)蛋白可调节线粒体呼吸链复合物的组装,进一步影响细胞有氧能量代谢。本研究以不同海拔藏猪肺组织为试验材料,分析了HIGD2A基因在不同海拔藏猪肺组织中的表达情况,利用在线生物信息学工具解析了HIGD2A基因的启动子特征,以及与HIGD2A基因潜在作用的miRNA。结果表明,HIGD2A基因在低海拔地区(500 m)的表达水平高于高海拔地区(3100 m和3850 m,P<0.01);通过在线生物信息学网站进一步分析发现,HIGD2A基因启动子上游1 489~1 760 bp和1 764~1 944 bp处存在2个CpG岛,转录因子Spi1/PU.1和SP1在该区域存在结合位点。使用Startbase和TargetScan数据库共筛选到21个与HIGD2A基因3'UTR潜在结合的miRNA,其中ssc-miR-140-5p、ssc-miR-181a和ssc-miR-181b的结合能分别为-19.1、-20.2 kcal/mol和-22.1 kcal/mol。此外,ssc-miR-140-5p与HIGD2A基因在不同海拔藏猪肺组织中存在相反的表达模式。本研究为藏猪适应高原低氧环境作用机制研究提供了理论依据。