本研究基于6只黑毛柯乐猪全基因组重测序对黑毛柯乐猪SNP和InDel突变位点进行挖掘并分析，对CDS区变异位点进行功能注释和通路分析。结果共检测到25 179 037个SNP和4 129 303个InDel,SNP和InDel变异位点主要分布于基因间隔区，其次是内含子区，而在CDS区的变异位点相对较少。对外显子区域的87 693个SNP和6 373个InDel变异位点进行GO和KEGG富集，发现诸多与免疫、代谢和感官等相关的基因，在KEGG通路中可发现多条与代谢、嗅觉信号和钙信号等相关的通路。本研究丰富了柯乐猪的遗传资源，为保护和开发柯乐猪提供了数据支持。