全国中文核心期刊
中国科技核心期刊
中国农林核心期刊
中国科学引文数据库 ( CSCD ) 来源期刊
R C C S E 中国权威学术期刊 ( A+ )
中国学术期刊综合评价数据库来源期刊
中国学术期刊 ( 网络版 ) 来源期刊
中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(08)   >>  173-177

遗传育种

大白猪全基因组ROH检测与分析

刘亚茹;孙超;于光辉;王源;

作者单位:

1.青岛农业大学动物科技学院2.济南市章丘区畜牧兽医事业发展中心

作者简介:

刘亚茹(1999-),女,山东济宁人,硕士研究生,主要从事猪遗传育种方面的研究,E-mail:yaruliu1010@163.com;

通讯作者:

王源(1989-),男,山西吕梁人,博士,主要从事猪遗传育种方面的教学与科研工作,E-mail:wangyuan@qau.edu.cn;0

PDF
200
引用
在线阅读
摘要
闭合
为研究人工选育背景下大白猪群体的近交情况和鉴定与经济性状相关的功能基因,本研究采用猪80 K SNP芯片对323头大白猪进行基因分型,检测长纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)的长度、数量及分布,计算基于ROH的个体近交系数,并鉴定高频ROH区域的功能基因。结果显示,共检测到24 652个ROH,平均长度为5.91 Mb,个体平均近交系数为0.202。在大白猪群体中检测到11个高频ROH区域,分布在1、4、6、9及18号染色体上。将高频ROH区域与Ensembl数据库比对,鉴定到313个基因,其中,PTN、BCL2、PHPP1基因与生长发育相关;SETDB1、PMAIP1基因与繁殖相关;TNFAIP8L2、PSMB4基因与免疫相关。将高频ROH区域与猪QTL数据库进行对比,共得到656个重叠QTL,涉及肉质、生产、繁殖以及健康等性状。本研究结果揭示了目标群体的近交情况,并为大白猪生产性能和抗病力的提高提供了参考依据。
参考文献
展开
相关文献
展开

期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033