单细胞转录组测序技术是在单个细胞水平上，通过分离细胞、构建文库、高通量测序及生物信息学分析，获取全基因组表达谱的技术。单细胞转录组测序可获得用于研究特定细胞亚群基因表达异质性的单细胞完整基因表达量数据，有助于识别未知或罕见的细胞类型，并奠定深入研究的基础。本文就单细胞转录组测序方法及其在猪遗传育种、抗病研究、生长发育上的应用进行综述，并探讨其局限性和应用前景。